《暗号》讲述川崎市发生连发爆炸事件。恐怖分子在街头安置了多枚炸弹，威胁政府释放政治犯。协助安全部队和消防队员的是“侦探事务所5”的侦探们。市长委托事务所设法拆除炸弹。侦探507是破解密码的天才。他一个接一个地解开了密码，阻止了爆炸，恐怖分子集团被逮捕归案。507收到了上海支部转来的委托，他被照片上从未见过的序列暗号迷住了。急欲一探密码全貌的507来到上海。等待他的是侦探523和会长。会长表示，507虽然擅解密码，但并不精于破案，因此特来支持，其实他还暗怀着其它目的。在情报贩子的帮助下，507来到一家夜总会
在冈村正（高桥克典饰）的推动下，依靠大企业捐助采购最先进设备和网罗优秀人才的全新经营模式的L&P医院日益壮大，它给医界新秀提供一展才华的空间，但同时为了盈利也想方设法赶走不会带来经济效益的病人，另一方面许多地方医院受到L&P医院的倾轧濒临破产。樱井综合医院正是这些举步维艰的小医院中的一个，院长樱井修三（平干二朗饰）原准备接受L&P医院的注资，但其爱徒朝田龙太郎（坂口宪二饰）的及时回归让他重燃希望。秉承为患者着想的无上理念，龙太郎先后找
明真大学附属医院的人气直线下滑，濒临破产的危机关头。在此时刻，干练果敢的医生鬼头笙子（夏木玛丽饰）脱去白衣，出任明真大学的校长。她针对医疗、研究等方面进行大刀阔斧的改革，并积极引进杰出人才，其中就包括医龙队伍的重要成员朝田龙太郎（坂口宪二饰）和加藤晶（稻森泉饰），以期他们帮助明真完成日本首例小儿心脏移植手术。经龙太郎建议，各自背负伤痛的藤吉圭介（佐佐木藏之介饰）和荒濑门次（阿部隆史饰）相继归队，加上之前驻守明真伊集院登（小池彻平饰），医龙团队黄金阵容全面复活。这群拥有赤诚理想的医者，能否达成他们心中的目标
为了完成世界第一高难度手术Batista的论文，明真大学的加藤晶（稲森いずみ饰）找到了曾领导过“医龙”（即世界最高水平救命医疗队）的朝田龍太郎（坂口憲二饰）帮忙。虽然在技术上是超一流的天才外科医生，朝田却因过于强烈的自我风格而遭到某些人的厌恶，最后所有的医院都将其拒之门外。来到明真后，朝田开始着手组建一支team完成手术，但他发现这里的医生似乎都是些碌碌之辈，不关心病人的死活，任何决策都以降低医院死亡率为出发点，就连直属上司野口教授（岸部一徳饰）也仅仅是将病人当作辅助自己登上院长之位的棋子。还由于对参与B
柴门暖（藤冈靛饰）生活在一个闭塞而偏僻的小渔村里，在这里，他即将携手自己最爱的女人目黑菫（山本美月饰）步入婚姻的殿堂。两人都以为，等待着他们的会是幸福美满的生活。村里一个名叫南条幸男（大仓忠义饰）的男人嫉妒柴门暖已久，他联手同样对柴门暖十分眼红的同事乐清（新井浩文饰）和警官入间公平（高桥克典饰），三人合作最终将柴门暖送进了监狱。柴门暖在监狱里一待就是15年，通过某个契机，他逃出生天，并且幸运的获得了大笔的财富，摇身一变成为了声名远扬的富翁，此时的柴门暖做出了重回故土的决定，他一天都没有忘记过那些卑鄙之人们
大学话剧社的聚会，让藤井惠美（香里奈饰）与后辈小仓咲（吉高由里子饰）、半泽真子（大岛优子饰）成为了合租房的室友。三人皆是单身，各有其无法恋爱的理由。27岁的藤井是位女照明师，男孩气十足，周围同事都不把她当女性看待，而她一直无法忘记前男友也是她的好哥们；24岁的小咲大学毕业迟迟无法找到理想的工作，在夜店做陪酒小姐，周旋于男人中间的她身心疲惫，觉得自己再也不会心动恋爱了；22岁的真子暗恋着派遣公司的上司，过于认真的性格让她在二人关系中一直处于被动且被人指责过于沉重。三人有了新的发展。藤井遇上了耿直又笨拙的警察
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